Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12153ArticlesСтатьиResearch ArticleCoordination of the Changes in Some Sites of the Hantaviral SegmentsКорреляция изменений, возникающих в отдельных участках сегментов генома хантавирусов15082012574VOL 57, NO4 (2012)ТОМ 57, №4 (2012)313509062023Copyright ©; 2012, Tyul’ko Z.S., Yakimenko V.V.Copyright ©; 2012, Тюлько Ж.С., Якименко В.В.2012Tyul’ko Z.S., Yakimenko V.V.Тюлько Ж.С., Якименко В.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12153

Correlation in the changes of the nucleotide and amino acid sequences at the Hantaan virus occurring in different parts of S- and M-segments were studied. The correlation was analyzed using comparison of substitutions in aligned nucleic sequences of the segments. Correlations of the nucleotide substitutions between S- and M-segments were observed. Probably, this coordination of the changes in both segments reflects features of the tertiary structure of RNA.

Изучали корреляции в изменениях нуклеотидной и аминокислотной последовательностей у хантавирусов генотипа Хантаан, происходящих в разных частых M- и S-сегментов. Корреляции выявляли путем сравнения замен в массивах выровненных нуклеотидных последовательностей сегментов. Были обнаружены ранее не выявленные корреляции замен нуклеотидов, локализующихся в разных (S, M) сегментах. Наличие таких корреляций может быть результатом корреляции изменений в этих сегментах, возникающей из-за особенностей третичной структуры молекул вирусной РНК.

hantavirusHantaannucleotides substitutionscorrelationхантавирусыХантааннуклеотидные заменыкорреляцииСлонова Р. А. и др. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом. - Владивосток, 2006.Тюлько Ж. С., Якименко В. В. Изучение филогенетических отношений хантавирусов с применением метода вычисления взаимной информации (на примере Хантаан-подобных вирусов // Хантавирусы и хантавирусные инфекции. - Владивосток, 2003. - С. 173-181.Тюлько Ж. С., Якименко В. В. К вопросу о темпах эволюции хантавирусов генотипа Пуумала // Тихоокеан. мед. журн. - 2008. - № 2. - С. 28-32.Тюлько Ж. С., Якименко В. В. Связанные замены в малом сегменте генома хантавирусов Старого света // Вопр. вирусол. -2008. - № 3. - С. 28-34.Alff P. J. et al. The NY-1 hantavirus Gn cytoplasmic tail coprecipitates TRAF3 and inhibits cellular interferon responses by disrupting TBK1-TRAF3 complex formation // J. Virol. - 2008. - Vol. 82. -P. 9115-9122.Estrada D. F. et al. The hantavirus glycoprotein G1 tail contains dual CCHC-type classical zinc fingers // J. Biol. Chem. - 2009. - Vol. 284. - P. 8654-8660.Haque A., Mir M. A. Interaction of hantavirus nucleocapsid protein (N) with ribosomal protein S19 // J. Virol. - 2010. - Vol. 84, N 23. -P. 12450-12453.Hepojoki J. et al. Cytoplasmic tails of hantavirus glycoproteins interact with the nucleocapsid protein // J. Gen. Virol. - 2010. - Vol. 91. - P. 2341-2350.Hjelle B., Torres-Pérez F. Hantaviruses in the Americas and their role as emerging pathogens // Viruses. - 2010. - Vol. 2. - P. 2559-2586.Huiskonen J. T. et al. Electron cryo-tomography of Tula hantavirus suggests a unique assembly paradigm for enveloped viruses // J. Virol. - 2010. - Vol. 84. - P. 4889-4897.Kukkonen S. K. J., Vaheri A., Plyusnin A. Completion of the Tula hantavirus genome sequence: properties of the L segment and heterogeneity found in the 3’ termini of S and L genome RNAs // J. Gen. Virol. - 1998. - Vol. 78. - P. 2615-2622.Lee H. W., Lee P. W., Johnson K. M. Isolation of the Hantaan virus, etiological agent of Korean hemorrhagic fever // J. Infect. Dis. -1978. - Vol. 137. - P. 298-308.Overby A. K., Pettersson R. F., Neve E. P. A. The glycoprotein cytoplasmic tail of uukuniemi virus (Bunyaviridae) interacts with ribonucleoproteins and is critical for genome packaging // J. Virol. -2007. - Vol. 81. - P. 3198-3205.Plyusnin A. Genetics of hantaviruses: implications to taxonomy. Brief review // Arch. Virol. - 2002. - Vol. 147. - P. 665-682.Plysnin A. et al. Transfection-mediated generation of functionally competent Tula hantavirus with recombinant S RNA segment // EMBO J. - 2002. - Vol. 21, N 6. - P. 1479-1503.Sironen T., Vaheri A., Plysnin A. Molecular evolution of puumala hantavirus // J. Virol. - 2001. - Vol. 75, N 23. - P. 11803-11810.Xu X. et al. The RNA binding domain of the hantaan virus N protein maps to a central, conserved region // J. Virol. - 2002. - Vol. 76, N 7. - P. 3301-3308.