Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12143ArticlesСтатьиResearch ArticlePolytypic strains in the genofund of tick-borne encephalitis virusПолитиповые штаммы в генофонде вируса клещевого энцефалита15062012573VOL 57, NO3 (2012)ТОМ 57, №3 (2012)303709062023Copyright ©; 2012, Pogodina V.V., Karan L.S., Kolyasnikova N.M., Gerasimov S.G., Levina L.S., Bochkova N.G., Andayev E.I., Trukhina A.G., Borisova T.I., Sidorova E.A., Nagibina O.A., Malenko G.V., Bezrukova E.G.Copyright ©; 2012, Погодина В.В., Карань Л.С., Колясникова Н.М., Герасимов С.Г., Левина Л.С., Бочкова Н.Г., Андаев Е.И., Трухина А.Г., Борисова Т.И., Сидорова Е.А., Нагибина О.А., Маленко Г.В., Безрукова Е.Г.2012Pogodina V.V., Karan L.S., Kolyasnikova N.M., Gerasimov S.G., Levina L.S., Bochkova N.G., Andayev E.I., Trukhina A.G., Borisova T.I., Sidorova E.A., Nagibina O.A., Malenko G.V., Bezrukova E.G.Погодина В.В., Карань Л.С., Колясникова Н.М., Герасимов С.Г., Левина Л.С., Бочкова Н.Г., Андаев Е.И., Трухина А.Г., Борисова Т.И., Сидорова Е.А., Нагибина О.А., Маленко Г.В., Безрукова Е.Г.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12143

Eighteen polytypic tick-borne encephalitis virus (TBEV) strains containing the fragments of E and NS1 protein genes of Siberian and Far Eastern, occasionally Siberian and European subtypes were isolated in the European and Asian parts of the tick-borne encephalitis (TBE) area. They were identified using real-time polymerase chain reaction, hybridization-fluorescence detection with genotype-specific probes, restriction fragment length polymorphism analysis, and E protein sequencing. The polytypic strains were isolated from individual Ixodes persulcatus ticks, their pools, from the blood of patients and the brain of dead patients. The isolation rates of the polytypic strains in the sympathry area of different TBEV subtypes ranged from 4.4% (the Irkutsk Region) to 15.1% (the Yaroslavl Region). In addition to 2 polytypic strains, a strain similar to the TBEV 886-84 strain was isolated. The TBEV subtypes entering into the composition of the polytypic strains show nongenetic interactions, such as neutral replication or competition. The polytypic strains are stable during passages in the cultured pig embryo kidney epithelial cells and on cloning. Mouse brain passage promotes dissociation of polytypic strains. The conditions for the formation of polytypic strains and their role in the etiology of TBE are discussed.

В европейской и азиатской частях ареала клещевого энцефалита (КЭ) изолированы 18 микстштаммов, содержащих фрагменты генов белков Е и NS1 сибирского и дальневосточного, иногда сибирского и европейского подтипов вируса КЭ (ВКЭ). Детекция проведена в ПЦР в реальном времени гибридизационно-флюоресцентным методом с генотипспецифическими зондами, методом анализа длин рестрикционных фрагментов и секвенированием Е-гена. Микстштаммы изолированы из отдельных клещей Ixodes persulcatus, пулов I. persulcatus и из крови больных и мозга умерших пациентов. Частота изоляции микстштаммов в зоне симпатрии разных подтипов ВКЭ колеблется от 4,4% (Иркутская область) до 15,1% (ярославская область). В забайкальском крае, помимо 2 микстштаммов, изолирован штамм, подобный 886-84-варианту ВКЭ. Подтипы ВКЭ, входящие в состав микстштаммов, находятся в негенетическом взаимодействии - нейтрализме и конкуренции. Микстштаммы стабильны при пассажах в культуре клеток СПЭВ и клонировании. Пассажи через мозг мышей способствуют диссоциации микстштаммов. Обсуждаются условия формирования микстштаммов и их роль в этиологии КЭ.

tick-borne encephalitis virusgenofundвирус клещевого энцефалитагенофондполитиповые штаммысмешанная инфекцияАндаев Е. И., Трухина А. Г., Карань Л. С. и др. Клещевой энцефалит в Читинской области и этиология очаговых форм с летальным исходом // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). - С. 60-65.Андаев Е. И., Борисова Т. И., Трухина А. Г. и др. Структура популяции вируса клещевого энцефалита в Забайкальском крае // Молекулярная диагностика-2010. - М., 2010. - Т. 2. - С. 206-208.Безрукова Е. Г. Роль сибирского подтипа вируса клещевого энцефалита в этиологии острых и хронических форм заболевания (сопоставление с дальневосточным подтипом): Дис.. канд. мед. наук. - М., 2009.Беликов С. И., Леонова Г. Н., Кондратов И. Г. и др. Анализ полногеномных последовательностей штаммов дальневосточного субтипа вируса клещевого энцефалита, обладающих различной нейровирулентностью для человека // Бюл. СО РАМН. - 2007. -№ 4 (126). - С. 22-28.Верхозина М. М., Козлова И. В., Дорощенко Е. К. и др. Биологические свойства и генетическая структура оригинальной группы штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Предбайкалья и Забайкалья // Журн. инфекц. патол. (Иркутск). - 2009. - Т. 16, № 3. - С. 83-84.Герасимов С. Г., Погодина В. В., Колясникова Н. М. и др. Взаимодействие сибирского и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита при микстинфекции в организме млекопитающих. I. Факторы, влияющие на тип взаимодействия // Вопр. вирусол. - 2011. - № 2. - С. 19-22.Герасимов С. Г., Погодина В. В., Колясникова Н. М. и др. Взаимодействие сибирского и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита при микстинфекции в организме млекопитающих. II. Конкуренция подтипов при острой и латентной инфекции // Вопр. вирусол. - 2011. - № 3. - С. 41-44.Демина Т. В., Джиоев Ю. П., Верхозина М. М. и др. Мультифокусное зондирование генома вируса клещевого энцефалита // Журн. инфекц. патол. (Иркутск). - 2009. - Т. 16, № 3. - С. 98-99.Злобин В. И., Демина Т. В., Верхозина М. М. и др. Антигенные и генетические типы вируса клещевого энцефалита // Вестн. Уральск. мед. акад. - 2010. - Вып. 21. - С. 85-89.Карань Л. С., Погодина В. В., Фролова Т. В., Платонов А. Е. Генетические различия восточноевропейской и азиатской популяций вируса клещевого энцефалита сибирского подтипа // Бюл. сиб. мед. - 2006. - № 5, прил. 1. - С. 24-27.Карань Л. С., Браславская С. И., Мязин А. Е. Развитие методов детекции и генотипирования вируса клещевого энцефалита на основе амплификационных технологий // Вопр. вирусол. - 2007. - № 6. - С. 17-22.Карань Л. С., Маленко Г. В., Бочкова Н. Г. и др. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. -2007. - № 4 (126). - С. 34-40.Колясникова Н. М., Карань Л. С., Лесникова М. В. и др. Своеобразие штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных в Вологодской области на протяжении 30-летнего периода // Современные научные и прикладные аспекты клещевого энцефалита. - М., 2007. - С. 64-65.Колясникова Н. М. Мониторинг структуры популяций вируса клещевого энцефалита в Уральском, Западно-Сибирском и Северозападном регионах России (вирусологические и молекулярнобиологические исследования): Дис.. канд. мед. наук. - М., 2008.Локтев В. Б. Вирус клещевого энцефалита. Генетические особенности и его изменчивость в современном мире // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4(126). - С. 14-21.Погодина В. В., Бочкова Н. Г., Дживанян Т. И. и др. Явление антигенной дефектности у циркулирующих в природе штаммов вируса клещевого энцефалита и его возможная связь с серонегативными формами заболевания // Вопр. вирусол. - 1992. - №2. - С. 103-107.Погодина В. В., Бочкова Н. Г., Карань Л. С. и др. Сибирский и дальневосточный подтипы вируса клещевого энцефалита в европейских и азиатских регионах России: генетическая и антигенная характеристика штаммов // Вопр. вирусол. - 2004. - №4. - С. 20-25.Погодина В. В., Карань Л. С., Колясникова Н. М. и др. Эволюция клещевого энцефалита и проблема эволюции возбудителя // Вопр. вирусол. - 2007. - № 5. - С. 16-21.Трухина А. Г. Особенности популяции возбудителя клещевого энцефалита в зоне распространения двух серотипов вируса на территории Прибайкалья: Дис.. канд. мед. наук. - Иркутск, 1989.Хаснатинов М. А., Данчинова Г. А., Кулакова Н. В. и др. Генетическая характеристика возбудителя клещевого энцефалита в Монголии // Вопр. вирусол. - 2010. - № 3. - С. 27-32.Demina T. V., Dzhioev Y. P., Verkhozina M. M. et al. Genotyping and characterization of the geographical distribution of tick-borne encephalitis virus variants with a set of molecular probes // J. Med. Virol. - 2010. - Vol. 86, N 6. - P. 965-976.Grard G., Moureau G., Charrel R. H. et al. Genetic characterization of tick-borne flaviviruses: new insight into evolution, pathogenetic determinants and taxonomy // Virology. - 2007. - Vol. 361, N 1. - P. 80-92.Khasnatinov M., Ustanikova K., Frolova T. V. et al. The molecular determinants of haemagglutinating-deficiency of natural isolates of tick-borne encephalitis virus // IX International congress of virology. - Istanbul, 2008. - P. 257.Khasnatinov M., Ustanikova K., Frolova T. V. et al. Non-haemagglutinating flaviviruses: molecular mechanisms of the emergence of new strains via adaptation to European ticks // http://dx.plos.org/10.1371/ journal.pone0007295.Ternovoy V. A., Kurzhukov G. P., Sokolov Y. V. et al. Tick-borne encephalitis virus with haemorrhagic syndrome, Novosibirsk Region, Russia, 1999 // Emerg. Infect. Dis. - 2003. - Vol. 9. - P. 743-746.Sidorova E., Andaev E., Borisova T. et al. Molecular-genetic heterogeneity of tick-borne encephalitis virus in Transbaikal Region // 21-st ECCMID/27-th ICC: Milan, 2011.