Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12072ArticlesСтатьиDetection of tick-borne encephalitis virus in Ixodes ticks collected in a natural focus of Gornyi AltaiДетекция вируса клещевого энцефалита в иксодовых клещах, собранных в природном очаге Горного Алтая15042011562NO2 (2011)№2 (2011)232609062023Copyright ©; 2011, Morozova O.V., Grishechkin A.E., Karan' L.S., Isaeva E.I., Shchuchinova L.D., Loginova N.V., Zlobin V.I., Morozova O.V., Grishechkin A.E., Karan L.S., Isayeva E.I., Shchuchinova L.D., Loginova N.V., Zlobin V.I.Copyright ©; 2011, Морозова О.В., Гришечкин А.Е., Карань Л.С., Исаева Е.И., Щучинова Л.Д., Логинова Н.В., Злобин В.И., Morozova O.V., Grishechkin A.E., Karan L.S., Isayeva E.I., Shchuchinova L.D., Loginova N.V., Zlobin V.I.2011Morozova O.V., Grishechkin A.E., Karan' L.S., Isaeva E.I., Shchuchinova L.D., Loginova N.V., Zlobin V.I., Morozova O.V., Grishechkin A.E., Karan L.S., Isayeva E.I., Shchuchinova L.D., Loginova N.V., Zlobin V.I.Морозова О.В., Гришечкин А.Е., Карань Л.С., Исаева Е.И., Щучинова Л.Д., Логинова Н.В., Злобин В.И., Morozova O.V., Grishechkin A.E., Karan L.S., Isayeva E.I., Shchuchinova L.D., Loginova N.V., Zlobin V.I.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12072

Enzyme immunoassay of tick-borne encephalitis virus (TBE) in the samples of Ixodes ticks collected in the outskirts of the settlement of Manzherok, Maiminsk District, Republic of Altai, revealed TBE antigen in 16.9±1.9% of the taiga ticks. Real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) with specific fluorescent probes and phylogenetic analysis of the nucleotide sequences of RT-RCR products corresponding to 5'-terminal fragment of the E gene of TBE, all the virus strains isolated from the ticks collected in Gornyi Altai were referred to as the Siberian genetic type that was dominant in virus-carrying ticks in the majority of endemic areas of Russia and near abroad. Viral load assays using the real-time RT-PCR with the probes indicated the threshold cycles Ct = 25.34-28.98, which, with regard to the efficiency of RNA identification and reverse transcription, was equal to about 104-105 viral RNA copies per tick.

Детекция вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) в образцах иксодовых клещей, собранных в мае 2007 г. в окрестностях поселка Манжерок Майминского района Республики Алтай, посредством иммуноферментного анализа показала наличие антигена ВКЭ в 16,9 ± 1,9% таежных клещей. На основании ОТ-ПЦР в реальном времени с генотипспецифичными флюоресцентными зондами и филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей продуктов ОТ-ПЦР, соответствующих 5'-концевому фрагменту гена E ВКЭ, все изоляты вируса, выделенные от клещей, собранных в Горном Алтае, отнесены к сибирскому генетическому типу, доминирующему в клещах-переносчиках в большинстве эндемичных областей России и ближнего зарубежья. Количественные оценки вирусной нагрузки посредством ОТ-ПЦР с зондами в реальном времени показали пороговые циклы Ct = 25,34-28,98, которые с учетом эффективности выделения РНК и обратной транскрипции соответствовали приблизительно 104-105 копиям вирусной РНК в клеще.

tick-borne encephalitis viruspig embryo kidney cellscytopathic effecthemagglutination reactionenzyme immunoassay for E antigenreverse transcription-polymerase chain reactionreal-time transcription-polymerase chain reactionвирус клещевого энцефалитаклетки почки эмбриона свиньицитопатический эффектреакция гемагглютинациииммуноферментный анализ на антиген EОТ-ПЦРПЦР в реальном времениБахвалова В. Н., Рар В. А., Ткачев С. Е. и др. Генетический анализ штаммов вируса клещевого энцефалита Западной Сибири // Вопр. вирусол. - 2002. - Т. 45, № 5. - С. 11-13.Злобин В. И., Мамаев Л. В., Джиоев Ю. П. и др. Генетические типы вируса клещевого энцефалита // Журн. инфекц. патол. - 1996. - № 4. - С. 13-17.Злобин В. И., Демина Т. В., Беликов С. И. и др. Генетическое типирование штаммов вируса клещевого энцефалита на основе анализа гомологии фрагмента гена белка оболочки // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. - С. 16-21.Злобин В. И., Верхозина М. М., Демина Т. В. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 2007. - № 6. - С. 4-13.Карань Л. С., Маленко Г. В., Бочкова Н. Г. и др. Применение молекулярно-генетических методик для изучения структуры штаммов вируса клещевого энцефалита // Бюл. СО РАМН. - 2007. - № 4 (126). - С. 34-40.Коклягина А. Т. Географическое распределение иксодовых клещей в Алтайском крае // Материалы краевой конференции микробиологов, эпидемиологов и инфекционистов по природно-очаговым заболеваниям в Алтайском крае. - Барнаул, 1967. - С. 31-37.Морозова О. В., Бахвалова В. Н., Панов В. В. Сравнение методов детекции вируса клещевого энцефалита // Фундаментальные науки - медицине. Новосибирск, 2008. - С. 171-177.Щипакин В. Н., Семашко И. В., Караванов А. С. и др. Оценка чувствительности иммуноферментного метода в определении инфекционного и неинфекционного антигенов вируса клещевого энцефалита // Вопр. вирусол. - 1989. - Т. 34, № 5. - С. 634-637.Щучинова Л. Д. Эпидемиологический надзор и контроль инфекций, передающихся клещами, в Республике Алтай: Автореф. дис. ... канд. мед. наук. - Омск, 2009.Clarke D. H., Casals J. Techniques for hemagglutination and hemagglutination-inhibition with arthropod-borne viruses // Am. J. Trop. Med. Hyg. - 1958. - Vol. 7. - P. 561-573.