<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Problems of Virology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Problems of Virology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Вопросы вирусологии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0507-4088</issn><issn publication-format="electronic">2411-2097</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Central Research Institute for Epidemiology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">12061</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Pandemic influenza in Russia. Diagnosis and molecular biological characteristics of the virus</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Пандемический грипп 2009 г. в России. Диагностика и молекулярно-биологические характеристики вируса</trans-title></trans-title-group></title-group><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2011-02-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>02</month><year>2011</year></pub-date><volume>56</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en">NO1 (2011)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">№1 (2011)</issue-title><fpage>17</fpage><lpage>21</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2023-06-09"><day>09</day><month>06</month><year>2023</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2011, Kiselev O.I., Komissarov A.B., Stukova M.A., Buzitskaya Z.V., Pisareva M.M., Elpaeva E.A., Danilenko D.M., Konovalova N.I., Gudkova T.M., Grigor'eva V.A., Smirnova T.S., Slita A.V., Romanovskaya-Roman'ko E.A., Tsybalova L.M., Sominina A.A., Eropkin M.Y., Grudinin M.P., Kiselev O.I., Komissarov A.B., Stukova M.A., Buzitskaya Z.V., Pisareva M.M., Elpaeva E.A., Danilenko D.M., Konovalova N.I., Gudkova T.M., Grigoryeva V.A., Smirnova T.S., Slita A.V., Romanovskaya-Romanko E.A., Tsybalova L.M., Sominina A.A., Eropkin M.Y., Grudinin M.P.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2011, Киселев О.И., Комиссаров А.Б., Стукова М.А., Бузицкая Ж.В., Писарева М.М., Елпаева Е.А., Даниленко Д.М., Коновалова Н.И., Гудкова Т.М., Григорьева В.А., Смирнова Т.С., Слита А.В., Романовская-Романько Е.А., Цыбалова Л.М., Соминина А.А., Еропкин М.Ю., Грудинин М.П., Kiselev O.I., Komissarov A.B., Stukova M.A., Buzitskaya Z.V., Pisareva M.M., Elpaeva E.A., Danilenko D.M., Konovalova N.I., Gudkova T.M., Grigoryeva V.A., Smirnova T.S., Slita A.V., Romanovskaya-Romanko E.A., Tsybalova L.M., Sominina A.A., Eropkin M.Y., Grudinin M.P.</copyright-statement><copyright-year>2011</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Kiselev O.I., Komissarov A.B., Stukova M.A., Buzitskaya Z.V., Pisareva M.M., Elpaeva E.A., Danilenko D.M., Konovalova N.I., Gudkova T.M., Grigor'eva V.A., Smirnova T.S., Slita A.V., Romanovskaya-Roman'ko E.A., Tsybalova L.M., Sominina A.A., Eropkin M.Y., Grudinin M.P., Kiselev O.I., Komissarov A.B., Stukova M.A., Buzitskaya Z.V., Pisareva M.M., Elpaeva E.A., Danilenko D.M., Konovalova N.I., Gudkova T.M., Grigoryeva V.A., Smirnova T.S., Slita A.V., Romanovskaya-Romanko E.A., Tsybalova L.M., Sominina A.A., Eropkin M.Y., Grudinin M.P.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Киселев О.И., Комиссаров А.Б., Стукова М.А., Бузицкая Ж.В., Писарева М.М., Елпаева Е.А., Даниленко Д.М., Коновалова Н.И., Гудкова Т.М., Григорьева В.А., Смирнова Т.С., Слита А.В., Романовская-Романько Е.А., Цыбалова Л.М., Соминина А.А., Еропкин М.Ю., Грудинин М.П., Kiselev O.I., Komissarov A.B., Stukova M.A., Buzitskaya Z.V., Pisareva M.M., Elpaeva E.A., Danilenko D.M., Konovalova N.I., Gudkova T.M., Grigoryeva V.A., Smirnova T.S., Slita A.V., Romanovskaya-Romanko E.A., Tsybalova L.M., Sominina A.A., Eropkin M.Y., Grudinin M.P.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12061">https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12061</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>The analysis of 1558 clinical samples revealed influenza virus A(H1N1v) RNA in 339 patients with influenza and 163 fatal cases,which was made in May to December 2009. Data on the antigenic properties of more than 250 of pandemic virus strains isolated at the Research Institute of Influenza and the molecular genetic characteristics of 31 strains are presented. All the test isolates were found to have the S203 substitution in hemagglutinin, which was characteristic of one of 5 minor genome A(H1N1v) virus variants found in the United States and Mexico in 2009. All the test strains contain the S31N substitution in the M2 protein, which determines viral resistance to adamantine, and have no H275Y substitution in neuraminidase, which determines oseltamivir resistance. The substitution of amino acid residue of Asp to Gly at position 222 of HA was found in 8 (73%) of 11 isolates from postmortem lung and trachea samples and in 2 (10%) of 20 isolates from nasopharyngeal swabs. The determination of the pathogenic role of this substitution calls for further investigations.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В период с мая по декабрь 2009 г. при анализе 1558 клинических образцов РНК вируса гриппа A(H1N1v) была обнаружена у 339 больных гриппом и 163 умерших. Представлены данные по антигенным свойствам более 250 штаммов пандемического вируса, выделенных в НИИ гриппа, и молекулярно-генетические характеристики 31 штамма. У всех исследованных изолятов в гемагглютинине (HA) выявлена замена S203T, характерная для одного из 5 минорных геномных вариантов вируса A(H1N1v), обнаруженных в США и Мексике в 2009 г. Исследованные штаммы содержат замену S31N в белке M2, определяющую устойчивость вирусов к адамантанам, и не имеют замены H275Y в нейраминидазе, определяющей устойчивость к озелтамивиру. В 8 (73%) из 11 изолятов, выделенных из постмортальных образцов легких и трахеи, и 2 (10%) из 20 изолятов, выделенных из носоглоточных смывов от больных, обнаружена замена аминокислотного остатка Asp на Gly в 222-м положении HA. Для установления патогенетической роли данной замены требуются дальнейшие исследования.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>pandemic influenza A(H1N1v) virus</kwd><kwd>hemagglutinin</kwd><kwd>antigenic properties</kwd><kwd>phylogenetic analysis</kwd><kwd>resistance</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>пандемический вирус гриппа A(H1N1v)</kwd><kwd>гемагглютинин</kwd><kwd>антигенная характеристика</kwd><kwd>филогенетический анализ</kwd><kwd>резистентность</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Бурцева Е. И., Иванова В. Е., Оскерно Т. А., Слепушкин А. Н. Свойства вирусов гриппа А и В, выделенных на куриных эмбрионах и в культуре клеток MDCK // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. - С. 29-33.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Выделение вирусов гриппа в клеточных культурах и куриных эмбрионах и их идентификация: Метод. рекомендации / Соминина А. А., Бурцева Е. И., Лобова Т. Г. и др. - СПб., 2006. - С. 24.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Львов Д. К., Бурцева Е. И., Прилипов А. Г. и др. Изоляция 24.05.2009 и депонирование в Государственную коллегию вирусов (ГКВ № 2452 от 24.05.2009) первого штамма A/Moscow/01/2009 (H1N1) swl, подобного свиному вирусу A(H1N1) от первого выявленного 21.05.2009 больного в Москве // Вопр. вирусол. - 2009. - № 5. - С. 10-14.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Смородинцева Е. А., Соминина А. А., Карпова Л. С. Сравнительные данные по развитию пандемии гриппа в России и других странах Европы // Материалы II ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням (29- 31 марта 2010 г.). - М., 2010. - С. 295.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Gambaryan A. S., Robertson J. S., Matrosovich M. N. Effects of egg adaptation on the receptor-binding properties of human influenza A and B viruses // Virology. - 1999. - Vol. 258. - P. 232-239.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Garten R. J., Davis C. T., Russell C. A. et al. Antigenic and genetic characteristics of swine-origin 2009 A(H1N1) influenza viruses circulating in humans // Science. - 2009. - Vol. 325. - P. 197.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Kendal A. P., Goldfield M., Noble G. R., Dowdle W. R. Identification and preliminary antigenic analysis of swine influenza-like viruses isolated during an influenza outbreak at Fort Dix, New Jersey // J. Infect. Dis. - 1977. - Suppl. - P. 381-385.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Nicholls J. M., Bourne A. J., Chen H. et al. Sialic acid receptor detection in the human respiratory tract: evidence for widespread distribution of potential binding sites for human and avian influenza viruses // Respir. Res. - 2007. - Vol. 8. - P. 73.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>2009 Pandemic influenza A(H1N1) virus mutations reported to be associated with severe disease (23 Dec. 2009). http:// ecdc.europa.eu/en/activities/sciadvice</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Shen J., Ma J., Wang Q. Evolutionary trends of A(H1N1) influenza virus hemagglutinin since 1918 // PloS One. - 2009. - Vol. 4, N 11. - P. e7789.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Tumpey T. M., Maines T. R., Van Hoeven N. et al. A two-amino acid change in the hemagglutinin of the 1918 influenza virus abolishes transmission // Science. - 2007. - Vol. 315. - P. 655-659.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Xu X., Rocha E. P., Regenery H. L. et al. Genetic and antigenic analyses of influenza A(H1N1) viruses, 1986-1991 // Virus Res. - 1993. - Vol. 28. - P. 37-55.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
