Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology12038ArticlesСтатьиInvestigation of genetic polymorphism of the integrase gene in the HIV-1 subtype A populations circulating in the Russian FederationПолиморфизм гена интегразы в популяциях ВИЧ-1 субтипа А, циркулирующих на территории Российской Федерации15102010555NO5 (2010)№5 (2010)202409062023Copyright ©; 2010, Gafarova I.E., Turbina G.I., Garaev M.M., Gafarova I.E., Turbina G.I., Garaev M.M.Copyright ©; 2010, Гафарова И.Э., Турбина Г.И., Гараев М.М., Gafarova I.E., Turbina G.I., Garaev M.M.2010Gafarova I.E., Turbina G.I., Garaev M.M., Gafarova I.E., Turbina G.I., Garaev M.M.Гафарова И.Э., Турбина Г.И., Гараев М.М., Gafarova I.E., Turbina G.I., Garaev M.M.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/12038

The paper presents the data of an investigation of the genetic polymorphism of the pol gene encoding viral integrase (IN) in a HIV subtype A infected population in the Lipetsk Region. The investigators analyzed 32 virus subtype A samples obtained in 2002-2007. Polymorphism at the codons associated with IN resistance to chemicals was observed in 7 virus variants. The found substitutions had a pattern of genetic polymorphism and were unassociated with resistance in 6 patients with the test subtype A population. At the same time, minor RAL resistance mutation was revealed in 1 (3.1%) virus variant while the similar mutations in the subtype G population were about 10%.

Представлены данные изучения генетического полиморфизма гена pol, кодирующего вирусную интегразу (ИН), популяции ВИЧ-1 субтипа А, циркулирующей на территории Липецкой области. В работе исследовали 32 образца вируса субтипа А, полученных за период 2002-2007 гг. Полиморфизм в кодонах, связанных с формированием устойчивости ИН к химиопрепаратам, наблюдали у 7 вариантов вируса. У 6 пациентов исследуемой популяции обнаруженные замены имеют характер генетического полиморфизма и не связаны с устойчивостью. При этом только у 1 (3,1%) варианта вируса выявлена минорная мутация устойчивости к RAL, в то время как аналогичные мутации в популяции субтипа G составляют около 10%.

RaltegravirElvitegravirgenetic polymorphismHIV infectionintegrasesubtype Asubtype Graltegravirelvitegravirгенетический полиморфизмВИЧ-инфекцияинтегразасубтип Асубтип GГафарова И. Э., Шидяева Ж. А., Санджиева Д. Б., Гараев М. М. Анализ полиморфизма гена интегразы в популяции ВИЧ-инфицированных из нозокомиальных очагов вспышки ВИЧ инфекции 1989 года на юге России // Вопр. вирусол. - 2001. - № 1. - C. 16-21.Пазилин А. С., Саухат С. Р. и др. Генетическая характеристика обратной транскриптазы субтипа G ВИЧ-1 // Вопр. вирусол. - 2007. - № 1. - С. 17-23.Покровский В. В., Ерамова И. Ю. и др. Внутрибольничная вспышка ВИЧ-инфекции в Элисте // Журн. микробиол. - 1990. - № 4. - С. 17-23.Ромашкин П. А., Саухат С. Р., Шемшура А. Б. и др. Ретроспективный анализ популяционной изменчивости области V3 gp120 в когорте ВИЧ-инфицированных, имеющих единый источник заражения // Вопр. вирусол. - 2003. - № 4. - С. 20-26.Турбина Г. И., Соломенцева М. Л., Кириллова Л. Д. и др. Эпидемиологическая характеристика ВИЧ-инфекции на территории Липецкой области в период 1993-2005 гг. // Вопр. вирусол. - 2006. - № 6. - С. 19-22.Barbaro G. et al. Highly active antiretroviral therapy: current state of the art, new agents and their pharmacological interactions useful for improving therapeutic outcome // Curr. Pharm. Des. - 2005. - Vol. 11. - P. 1805-1843.Chen X., Tsiang M., Yu F. et. al. Modeling, analysis, and validation of a novel HIV integrase structure provide insights into the binding modes of potent integrase inhibitors // J. Mol. Biol. - 2008. - Vol. 380. - P. 504-519.Cohen J. Therapies. Confronting the limits of success // Science. - 2002. - Vol. 296. - P. 2320-2324.Cohen J. Retrovirus meeting. Novel attacks on HIV move closer to reality // Science. - 2006. - Vol. 311. - P. 943.Fujishita T., Yoshinaga T., Sato A. Preparation of aromatic heterocycle compounds having HIV integrase inhibiting activities. Int. Pat. WO2000039086 (The World Intellectual Property Organization).Hazuda D., Miller M. D., Nguyen B. Y., Zhao J. // Abstracts XVI International HIV Drug Resistance Workshop. - St. Michael, Barbados, 2007. - Abstr. 8.Malet I., Delelis О., Valantin M. et al. Mutations Associated with failure of raltegravir treatment affect integrste sensitivity to the inhibitor in vitro // Antimicrob. Agents Chem. - 2008. - Vol. 52. - P. 1351-1358.Marchand C., Zhang X., Pais G. C. et al. Structural determinants dor HIV-1 integrase inhibition by beta-diketo acid // J. Biol. Chem. - 2002. - Vol. 277. - P. 12596-12603.Markowitz M., Morales-Ramirez J. O., Nguyen B. Y. et al. Antiretroviral activity, pharmacokonetics, and tolerability of MK-0518, a novel inhibitor of HIV-1 integrase, dosed as monotherapy for 10 days in treatment-naive HIV-1-infected individuals // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. - 2006. - Vol. 43. - P. 509-515.Miller M., Witmer M., Stillmock K. et al. // Abstracrs 16-th Int. ernational Conference AIDS. - Toronto, 2006. - Abstr. THAA0302.Pommier Y. et al. Integrase inhibitors to treat HIV/AIDS // Nat. Rev. Drug Discov. - 2005. - Vol. 4. - P. 236-248.Sato M. et al. Novel HIV-1 integrase inhibitors derived from quinolone antibiotics // J. Med. Chem. - 2006. - Vol. 49. - P. 1506-1508.Sato M., Kawakami H., Itoh H. et al. Preparation of 4-oxoquinoline derivatives as HIV integrase inhibitors // J. Med. Chem. - 2004. - Vol. 47. - P. 5298-5303.Shimura K., Kodama E., Sakagami Y. et al. Broad antiretroviral activity and resistance profile of the novel human immunodeficiency virus integrase inhibitor elvitegravir (JTK-303/GS-9137) // J. Virol. - 2008. - Vol. 82. - P. 764-774.Wai J. S., Egbertson M. S., Payne L. S. et al. 4-Aryl-2,4-dioxobutanoic acid inhibitory of HIV-1 integrase and viral replication in cells // J. Med. Chem. - 2000. - Vol. 43. - P. 4923-4926.