Problems of VirologyProblems of VirologyВопросы вирусологии0507-40882411-2097Central Research Institute for Epidemiology11998ArticlesСтатьиS3 gene fragment sequence analysis in the chicken reovirus isolates detected in the poultry farms of the Russian FederatoinАнализ последовательности участка гена S3 изолятов реовируса кур, выявленных на птицефабриках РФ15042010552NO2 (2010)№2 (2010)91309062023Copyright ©; 2010, Zinyakov N.G., Andreychuk D.B., Drygin V.V., Zinyakov N.G., Andreychuk D.B., Drygin V.V.Copyright ©; 2010, Зиняков Н.Г., Андрейчук Д.Б., Дрыгин В.В., Zinyakov N.G., Andreychuk D.B., Drygin V.V.2010Zinyakov N.G., Andreychuk D.B., Drygin V.V., Zinyakov N.G., Andreychuk D.B., Drygin V.V.Зиняков Н.Г., Андрейчук Д.Б., Дрыгин В.В., Zinyakov N.G., Andreychuk D.B., Drygin V.V.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11998

The paper presents data on the comparative analysis of nucleotide sequences of a S3 gene fragment of 67 chicken reovirus (CRV) isolates from the abnormal biopsy specimens tested in 1999 to 2007. These CRV isolates were ascertained to differ from vaccine strains in the nucleotide sequence of the S3 gene. The approximate substitution rates for the S3 gene were established to range from 2.0x10-3 to 6.0x10-3 nucleotide substitutions per year.

Представлены данные по сравнительному анализу нуклеотидных последовательностей фрагмента гена S3 67 изолятов реовируса кур (РК), выявленных в пробах патологического материала, поступившего на исследование с 1999 по 2007 г. Установлено, что данные изоляты РК по нуклеотидной последовательности гена S3 отличались от вакцинных штаммов. Была рассчитана приблизительная скорость накопления нуклеотидных замен для данного гена, варьирующая от 2,010-3 до 6,010-3 замен на 1 нуклеотид в год.

chicken reoviruspolymerase chain reactionS3 genegenetic analysisреовирус курполимеразная цепная реакцияген S3генетический анализАндрейчук Д. Б., Колосов С. Н., Дрыгин В. В. Оценка эффективности использования разных систем праймеров для проведения индикации и дифференциации российских изолятов ортореовируса кур методами ПЦР и прямого секвенирования // Генодиагностика инфекционных заболеваний: Сборник тезисов 4-й Всероссийской науч.-практ. конф. - М., 2002. - С.Грибанов О. Г., Щербаков А. В., Перевозчикова Н. А., Гусев А. А. Использование Аэросила А-300 и фильтров GF/F (GF/C) для очистки ДНК-фрагментов, плазмидной ДНК и РНК // Биохимия. - 1996. - Т, 61, № 6. - С. 1064-1080.Fachey J. E., Crowley J. F. Studies of cronic respiratory disease of chickens. II Isolation of a virus // Can. J. Comp. Med. - 1954. - Vol. 18. - P. 13-21.Hung J. Liu, Long H. Lee, Hsiao W. Hsu et al. Molecular evolution of avian reovirus: evidence for genetic diversity and reassortment of the S-class genome segments and multiple cocirculating lineages // Virology. - 2003. - Vol. 314, N 1. - P. 336-349.Jones R. C., Nwajei B. N. Reovirus-induced tenosynovitis: persistence of homologous challenge virus in broiler chicks after vaccination of parents // Res. Vet. Sci. - 1985. - Vol. 39, N 1. - P. 39-41.Jones R. C. Avian reovirus infections // Rev. Sci. Tech. Off. Int. Epiz. - 2000. - Vol. 19. - P. 614-625.Kant A., Balk F., Born L. et al. Classification of Dutch and German avian reoviruses by sequencing the sigma C protein // Vet. Res. - 2003. - Vol. 34, N 2. - P. 203-212.Lindsay Noad, Jingyun Shou, Kevin M. Coombs et al. Sequences of avian reovirus M1, M2 and M3 genes and predicted structure/function of the encoded μ proteins // Virus Res. - 2006. - Vol. 116, N 1-2. - P. 45-57.Miller Jeffrey E., Charles E. Samuel. Proteolytic cleavage of the reovirus sigma 3 protein results in enhanced double-stranded RNA-binding activity: Identification of a repeated basic amino acid motif within the C-terminal binding region // J. Virol. - 1992. - Vol. 60. - P. 5347-5356.Pin Chun Shen, Yu Fang Chiou, Hung Jen Liu et al. Genetic variation of the λA and λC protein encoding genes of avian reoviruses // Res. Vet. Sci. - 2007. - Vol. 83, N 3. - P. 394-402.Sellers H., Linnemann E., Pereira L. et al. Phylogenetic analysis of the sigma 2 protein gene of Turkey reoviruses // Avian Dis. - 2004. - Vol. 48, N 3. - P. 651-657.Songserm T., Pol J., van Roozelaar D. et al. A comparative study of the pathogenesis of malabsorption syndrome in broilers // Avian Dis. - 2000. - Vol. 44, N 3. - P. 556-557.Takehara K., Kimura Y., Tanaka Y., Yoshimura M. Preparation and characterization of monoclonal antibidies against an avian reovirus // Avian Dis. - 1987. - Vol. 31, N 4. - P. 730-734.Van der Heide L. The history of avian reovirus // Avian Dis. - 2000. - Vol. 44, N 3. - P. 638-641.Wilson G. J., Nason E. L., Hardy C. S. et al. A single mutation in the carboxy terminus of reovirus outer-capsid protein sigma 3 confers enhanced kinetics of sigma 3 proteolysis, resistance to inhibitors of viral disassembly, and alterations in sigma 3 structure // J. Virul. - 2002. - Vol. 76, N 19. - P. 9832-9843.