A possibility of using the amplification of gene HN fragment in combination with nucleotide cDNA sequencing for the purpose of identification and strain differentiation of bovine parainfluenza-3 virus was demonstrated. A comparative analysis of the primary structure in the studied HN gene fragment revealed 2 genetic groups among the investigated virus' strains and isolates. Group 1 is made up of Northern American viral strains and of Russian isolates, whose primary structure has a high level of homology to the primary SF-4/32 strain structure; group 2 comprises the virus' Russian isolates with a high level of homology to the mentioned strains to Japanese strains' sequences. The biggest differences between the studied strains and the viral isolates amounted to around 8%, when the nucleotide sequences were compared, and to around 4%, when the corresponding amino-acid sequences were compared.
Показана возможность использования амплификации фрагмента гена HN в сочетании с нуклеотидным секвенированием кДНК для индикации и штаммовой дифференциации вируса парагриппа-3 крупного рогатого скота. Сравнительный анализ первичной структуры изучаемого фрагмента гена HN показал, что среди исследованных штаммов и изолятов вируса выделяются 2 генетические группы. Одну из них образуют североамериканские штаммы вируса и российские изоляты, первичная структура которых имеет высокий уровень гомологии с первичной структурой штамма SF-4/32, а другую - российские изоляты вируса, имеющие высокий уровень гомологии данного фрагмента с последовательностями японских штаммов. Наибольший уровень различий между исследованными штаммами и изолятами вируса составил около 8% при сравнении нуклеотидных последовательностей и около 4% при сравнении соответствующих им аминокислотных последовательностей.