<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Problems of Virology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Problems of Virology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Вопросы вирусологии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0507-4088</issn><issn publication-format="electronic">2411-2097</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Central Research Institute for Epidemiology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">11813</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Identification of bovine diarrhea virus. Genotyping and phylogenetic analysis of isolates obtained in the territory of the Russian Federation</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Индикация вируса диареи крупного рогатого скота, генотипирование и филогенетический анализ изолятов, выявленных на территории Российской Федерации</trans-title></trans-title-group></title-group><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2003-10-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>10</month><year>2003</year></pub-date><volume>48</volume><issue>5</issue><issue-title xml:lang="en">NO5 (2003)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">№5 (2003)</issue-title><fpage>41</fpage><lpage>46</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2023-06-09"><day>09</day><month>06</month><year>2023</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2003, Schulpin M.I., Ayanot P.K., Mischenko V.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2003, Шульпин М.И., Аянот П.К., Мищенко В.А.</copyright-statement><copyright-year>2003</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Schulpin M.I., Ayanot P.K., Mischenko V.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Шульпин М.И., Аянот П.К., Мищенко В.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11813">https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11813</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Bovine diarrhea virus (BDV) is widespread throughout the European part of the Russian Federation. The BDV genome is detected in around 40% of animals (aged up to 18 months) with lesions in the gastrointestinal tract and respiratory system. It can be found in all intestinal sections, including its contents and feces, in lymphoid and respiratory organs as well as in nasal washings and discharges and in vaginal tunic discharges of cows. Primary structure analysis of 5'-untransalted region of the genome of the detected isolates revealed that all of them belonged to genotype 1. Phylogenetic analysis confirmed that a part of isolates belonged to subgenotype 1a, while most isolates make up a separate group. No geographic differences were reported in the circulation of the BDV genetic variants within Russia's territory.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Показано, что вирус диареи крупного рогатого скота (ВД КРС) широко распространен на территории европейской части РФ. Геном данного вируса выявляется у животных с поражениями органов желудочно-кишечного тракта и органов дыхания до 18 мес с одинаковой частотой, составляющей примерно 40%. Геном ВД КРС может выявляться во всех отделах кишечника, в том числе в его содержимом и фекалиях, в лимфоидных органах, в органах дыхательных путей, носовых смывах и истечениях, а также в смывах со слизистой оболочки влагалища у коров. Анализ первичной структуры 5'-НТО выявленных изолятов показал, что все они относятся к генотипу 1. Филогенетический анализ подтвердил, что часть изолятов относится к субгенотипу 1а, однако большая часть формирует обособленную группу. На территории России нет географического разделения в циркуляции этих генетических вариантов ВД КРС.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>bovine diarrhea virus</kwd><kwd>polymerase chain reaction</kwd><kwd>5'-untraslatedregion</kwd><kwd>genotyping</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>вирус диареи КРС</kwd><kwd>полимеразная цепная реакция</kwd><kwd>5'-нетранслируемая область</kwd><kwd>генотипирование</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Вечеров А. Е., Дороненкова Г. Н., Лисицын В. В. и др. Применение ПЦР и нуклеотидного секвенирования гена HN для выявления и штаммовой дифференциации вируса парагриппа-3 КРС //Достижения молодых ученых - в ветеринарной практике: Материалы конф. молодых ученых. - Владимир, 2000. - С. 207-212.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Грибанов О. Г., Щербаков А. В., Перевозчикова Н. А. и др. Простой метод выделения и очистки РНК // Биоорган, химия. - 1997. - Т.-23, № 9. - С. 763-765.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Кудрявцев В. А., Дороненкова Г. Н., Аянот П. К., Гусев А. А. ПЦР и секвенирование вариабельной области гемагглютининэстеразного гена коронавируса КРС // Вестн. РАСХН. - 2002. - № 4. - С. 341-344.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Чупин С. А., Дороненкова Г. Н., Прохватилова Л. Б., Аянот П. К. Использование ПЦР и нуклеотидного секвенирования для дифференциации G-серотипов ротавирусов КРС // Достижения молодых ученых - в ветеринарной практике: Материалы конф. молодых ученых. - Владимир, 2000. -С. 184-190.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Baker J. С. Bovine viral diarrhea virus: a review // J. Am. Vet. Med. Assoc. - 1987. - Vol. 190, N 11. - P. 1449-1458.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Bolin S. R., McClurkin A. W., Cutlip R. C., Coria M. F. Severe clinical disease induced in cattle persistently infected with noncytopathic bovine viral diarrhea virus by superinfection with cytopathic bovine viral diarrhea virus // Am. J. Vet. Res. - 1985. - Vol. 46. - P. 573-576.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Bolin S. R., Littledike E. Т., Ridpath J. F. Serologic detection and practical consequences of antigenic diversity among bovine viral diarrhea viruses in a vaccinated herd // Ibid. - 1991. - Vol. 52. - P. 1033-1037.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Boye M., Kamstrup S., Dalsgaard K. Specific sequence amplification of bovine viral diarrhea virus (BVDV) and hog cholera virus and sequencing of BVDV nucleic acid // Vet. Microbiol. - 1991. -Vol. 29. - P. 1-13.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Brownlie J., Clarke M. C., Howard С. J. Experimental production of fatal mucosal disease in cattle // Vet. Rec. - 1984. - Vol. 114. - P. 535-536.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Collet M. S., Larson R., Gold С. et al. Molecular choning and nucleotide sequence of the pestivirus bovine viral diarrhea virus // Virolody. - 1988. - Vol. 165, N I. - P. 191-199.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Corapi W. M., Elliott R. D., French T. W. et al. Thrombocytopenia and hemorrhager in veal calves infected with bovine viral diarrhea virus // J. Am. Vet. Med. Assoc. - 1990. - Vol. 196, N 4. - P. 590-596.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>David G. P., Crawshaw T. R., Gunning R. F. Sever disease in adult dairy cattle in three UK dairy herds associated with bovine viral diarrhea virus infection // Vet. Rec. - 1994. - Vol. 134, - P. 468-472.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Katz J. В., Ridpath J. F., Bolin S. R. Presumptive diagnostic differentiation of hog cholera virus from bovine diarrhea and border disease viruses by using a cDNA nestedamplification approach // J. Clin. Microbiol. - 1993. - Vol. 31. - P. 565568.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Murphy F. A., Fauquet С. M., Bishop D. H. L. // Virus taxonomy - the classification and nomenclature of viruses: 6-th Rep. Int. Committee on Taxonomy of Viruses. - Vienna, 1995.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Pellerin C., van den Hurk J., Lecomte J., Tijssen P. Identification of a new group of bovine virel diarrhea virus strains associated with severe outbreaks and high mortalities // Virology. - 1994. - Vol. 203, N 2. - P. 260-268.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Pellerin C., Moir S., Lecomte J., Tijssen P. Comparison of the pi 25 coding region of bovine viral diarrhea virus // Vet. Microbiol. - 1995. - Vol. 45. - P. 45-57.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Radostits О. М., Littlejohns I. R. New concepts in the pathogenesis diagnosis and control of disease caused by the bovine viral diarrhea virus // Can. Vet. J. - 1988. - Vol. 29. - P. 513528.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Ridpath J., Bolin S., Dubovi E. Segregation of bovine viral diarrhea virus into genotypes // Virology. - 1994. - Vol. 205, N 1. - P. 66-74.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Sanger F., Nicklen S., Coulsen A. R. DNA sequencing with chain terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1977. - Vol. 74. - P. 5463-5467.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
