<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Problems of Virology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Problems of Virology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Вопросы вирусологии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0507-4088</issn><issn publication-format="electronic">2411-2097</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Central Research Institute for Epidemiology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">11755</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Examinations of birds in the Volga delta (Astrakhan region, 2001) for Western Nile Fever virus by using the method of reverse transcription - polymerase chain reaction</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Обследование птиц дельты Волги (Астраханская область, 2001 г.) на наличие вируса лихорадки Западного Нила методом обратной транскрипции - полимеразной цепной реакции</trans-title></trans-title-group></title-group><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2003-02-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>02</month><year>2003</year></pub-date><volume>49</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en">NO1 (2003)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">№1 (2003)</issue-title><fpage>14</fpage><lpage>17</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2023-06-09"><day>09</day><month>06</month><year>2023</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2003, Alkhovsky S.V., Lvov D.I., Samokhvalov E.I., Prilipov A.G., Lvov D.K., Aristova V.A., Gromashevsky V.L., Dzharkenov A.F., Kovtunov A.I., Deryabin P.G., Odolevsky E.I., Ibragimov P.M.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2003, Альховский С.В., Львов Д.И., Самохвалов Е.И., Прилипов А.Г., Львов Д.К., Аристова В.А., Громашевский В.Л., Джаркенов А.Ф., Ковтунов А.И., Дерябин П.Г., Одолевский Е.И., Ибрагимов Р.М.</copyright-statement><copyright-year>2003</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Alkhovsky S.V., Lvov D.I., Samokhvalov E.I., Prilipov A.G., Lvov D.K., Aristova V.A., Gromashevsky V.L., Dzharkenov A.F., Kovtunov A.I., Deryabin P.G., Odolevsky E.I., Ibragimov P.M.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Альховский С.В., Львов Д.И., Самохвалов Е.И., Прилипов А.Г., Львов Д.К., Аристова В.А., Громашевский В.Л., Джаркенов А.Ф., Ковтунов А.И., Дерябин П.Г., Одолевский Е.И., Ибрагимов Р.М.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11755">https://virusjour.crie.ru/jour/article/view/11755</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Infection of birds, residing in the Volga lower and middle delta, with West Nile Virus (WNV) genome was detected by the RT-PCR method. A total of 315 samples of bird organs, collected in the Astrakhan region in August 2001, were examined. Positive results, with various severity degrees, were found in coots (15.1%) and in cormorants (14.3%) in the lower delta. As for the middle delta, the infection rate among coots, herons, sea-gulls and terns was found to be identical and amounted to 8-13%, it was essentially higher in cormorants - 42%. The infection rate of land-based birds did not exceed 5% in synanthropic biocenosis. According to a partial sequencing of the 5'end region of WNV genome, all positive tests can be described as belonging to the 1st WNV genotype. The obtained results are indicative of a high activity of circulation of WNV among the birds of the water and near-water complexes in the mentioned region.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Методом ОТ-ПЦР исследована зараженность вирусом лихорадки Западного Нила (ЛЗН) птиц, заселяющих нижнюю и среднюю части дельты Волги. Обследовано 315 образцов органов птиц, собранных в Астраханской области в августе 2001 г. В авандельте положительные результаты обнаружены в равной степени у лысух (15,2%) и бакланов (14,3%). В средней части дельты зараженность лысух, цапель, чаек и крачек оказалась одного порядка (8-13%), у бакланов - существенно выше (42%). Зараженность птиц наземного комплекса в синантропных биоценозах не превысила 5%. По данным частичного секвенирования 5'-концевой области генома все положительные пробы были отнесены к 1-му генотипу вируса ЛЗН. Полученные результаты свидетельствуют о высокой активности циркуляции вируса ЛЗН среди птиц водного и околоводного комплексов данного региона.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>West Nile Fever</kwd><kwd>virus</kwd><kwd>genotype</kwd><kwd>polymerase chain reaction</kwd><kwd>birds</kwd><kwd>virus circulation</kwd><kwd>Volga delta</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>лихорадка Западного Нила</kwd><kwd>вирус</kwd><kwd>генотип</kwd><kwd>обратная транскрипция - полимеразная цепная реакция</kwd><kwd>птицы</kwd><kwd>циркуляция вируса</kwd><kwd>дельта Волги</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Бутенко А. М., Чумаков М. П., Башкирцев В. Н. Выделение штаммов вируса Западного Нила в Астраханской области из комаров и ворон // Материалы науч.-практ. конф. медицинских работников Астраханской области. - Астрахань, 1969. - С. 39-40.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Бутенко А. М., Ковтунов А. И., Хуторецкая Н. В. и др. Выделение штамма Аст 901 вируса Западного Нила из крови больного человека в Астраханской области в 2000 г. // Вопр. вирусол. - 2001. - № 4. - С. 31-32.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Вышемирский О. И., Жуков А. Н., Прилипав А. Г. и др. Выделение вируса лихорадки Западного Нила от больного менингоэнцефалитом в Волгоградской области в 2000 г. // Там же. - С. 33-34.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Львов Д. К., Ильичев В. Д. Миграции птиц и перенос возбудителей инфекции. - М., 1979.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Львов Д. К. Лихорадка Западного Нила // Вопр. вирусол. - 2000. - № 2. - С. 4-9.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Львов Д. К., Бутенко А. М., Гайдамович С. Я. и др. Эпидемические вспышки менингита и менингоэнцефалита в Краснодарском крае и Волгоградской области, вызванные вирусом Западного Нила // Там же. - № 1. - С. 37-38.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Львов Д. К., Бутенко А. М., Вышемирский О. И. и др. Выделение вируса лихорадки Западного Нила от больных людей в период эпидемической вспышки в Волгоградской и Астраханской областях // Там же. - № 3. - С. 9-12.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Львов Д. К, Джаркенов А. Ф., Львов Д. Н. и др. Изоляция вируса лихорадки Западного Нила (ЛЗН) от большого баклана Phalacrocorax carbo, вороны Corvus corone и собранных с нее клещей Hyalomma marginatus в природных и синантропных биоценозах в дельте Волги, Астраханская область 2001 г. // Там же. - 2002. - № 5. - С. 7-12.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Львов Д. К., Нетесов С. В., Бутенко А. М. и др. Молекулярная эпидемиология вирусов лихорадки Западного Нила (ЛЗН) и Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ) на юге России (по материалам 1999-2001 гг.) // Материалы 8-го Всероссийского съезда эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. - М., 2002. - Т. I. - С. 356-357.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Львов Д. К., Джаркенов А. Ф., Аристова В. А. и др. Изоляция вирусов Дхори (Orthomyxoviridae, Thogotovirus) и Крымской-Конго геморрагической лихорадки (ККГЛ) (Bunyaviridae, Nairovirus) от зайца (Lepus europeaus) и собранных с него клещей Hyalomma marginatus в средней зоне дельты Волги, Астраханская область 2001 г. // Вопр. вирусол. - 2002. - № 4. - С. 32-36.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Прилипов А. Г., Самохвалов Е. И., Львов Д. К. и др. Генетический анализ вирусов лихорадки Западного Нила, выделенных на юге Русской равнины (Волгоградская и Астраханская области) в 1999 г. // Там же. - 2001. - № I. - С. 8-12.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Прилипов А. Г., Кинни Р. М., Самохвалов Е. И. и др. Анализ новых вариантов вируса лихорадки Западного Нила // Там же. - 2002. - № 4. - С. 36-41.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Шахунова И. В., Згурская Н., Березин В. В. и др. Вирус Западного Нила в СССР. Сообщение 3. Выделение еще одного штамма вируса Западного Нила от клещей Hyalomma plumbeum plumbeum Panz в Астраханской области // Эпидемические вирусные инфекции: Труды ИПВЭ АМН СССР. - М., 1968. - Т. 12. - С. 389-401.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Anderson J. F., Anderson Т. Y., Vossbrinck С. R. et al. Isolation of West Nile vims from mosquitoes and a Cooper's Hawk in Connecticut // Science. - 1999. - Vol. 286. - P.2331-2333.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Bernard K. A., Mattei J. Y., Jones S. A. et al. West Nile virus infection in birds and mosquitoes, New York tate, 2000 // Emerg. Infect. Dis. - 2001. - Vol. 7. - P. 679-685.</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Eidson M., Komar N., Sorhage F. et al. Crow deaths as a sentinel surveillance system for West Nile virus in to northeastern United States, 1999 // Ibid. - P. 615-620.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Eidson M., Kramer L., Stone W. et al. Dead birds surveillance as an early warming system for West Nile virus // Ibid. - P. 631-635.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Eidson M., Miller Y., Kramer L. et al. Dead crow densities and human cases of West Nile virus, New York State, 2000 // Ibid. - P. 662-664.</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Hadler J., Nelson R., McCarthy T. et al. West Nile virus surveillance in Connecticut in 2000: An intense epizootic without high risk for severe human diseases // Ibid. - P. 636-642.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Jhonson D. J., Ostlund E. N., Pedersen D. D. et al. Detection of North American West Nile virus in animal tissue by a reverse transcription-nested polymerase chain reaction assay // Ibid. - P. 739-741.</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Komar N., Panella N. A., Burns J. E. et al. Serologic evidence for West Nile virus infection in birds in the New York city vicinity during an outbreak in 1999 // Ibid. - P. 621-625.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Kulasekera V. L., Kramer L., Nasci R. S. et al. West Nile virus infection in mosquitoes, birds, horses and humans, States Island, New York, 2000 // Ibid. - P. 722-725.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Lanciotti R. S., Roehrig J. Т., Deubel V. et al. Original the West Nile virus responsible for an outbreak of encephalitis in the northeastern United States // Science. - 1999. - Vol. 286. - P. 2333-2337.</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Lvov D. K., Kovtunov A. I., Butenko A. M. et al. West Nile fever (WNF) in Southern Russia - epidemiological, clinical peculiarities (1999-2001) // Proceedings of the 12-th International Congress of Virology. - Paris, 202.</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Malkinson M., Banet C., Weisman Y. et al. Introduction of West Nile virus in the Middle East by migrating white storks // Emerg. Infect. Dis. - 2002. - Vol. 8. - P. 392-397.</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>Martin A. A., Petersen L. R., Eidsion M. et al. Widespread West Nile virus activity in the Eastern United States, 2000 // Ibid. - P. 730-735.</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>Panella N. A., Kerst A. J., Lanciotti R. S. et al. Comparative West Nile virus detection in organs of naturally infected American crows (Corvus brachyrhynchos) // Ibid. - P. 754-755.</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><mixed-citation>Savage H. M., Ceianu C., Nicolescu Y. et al. Entomological and avian investigations of an epidemic of West Nile fever in Romanian in 1996, with serological and molecular characterization of virus isolate from mosquitoes // Am. J. Trop. Med. - 1999. -Vol.61. - P. 600-611.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
